Охрану территории заповедника «Брянский лес» и заказника «Клетнянский», находящего в ведении заповедника, осуществляют государственные инспекторы. Штат службы охраны состоит из 27 человек. В 2011 году создана оперативная группа, численностью пять человек. Опергруппа оснащена современной техникой и средствами связи. Основные задачи опергруппы: борьба с браконьерством; патрулирование подконтрольных территорий, в первую очередь районов и участков, наиболее подверженных угрозе браконьерства и возникновения пожаров; контроль за соблюдением установленного режима охраны территории подконтрольных ООПТ; участие в тушении пожаров и др.
За 2011 года на территории заповедника, в его охранной зоне и на территории «Клетнянский» составлено 56 протоколов. Больше всего нарушений природоохранного законодательства приходится на незаконное рыболовство — 24 протокола. Выявлены также нарушения о незаконном нахождении на территории заповедника и незаконной охоте, соответственно 18 и 11 протоколов. Задержано 42 нарушителя, в том числе 8 человек с оружием. У нарушителей изъято 104 орудия незаконного лова рыбы, 72 ловчих петли и 4 гладкоствольных ружья. На нарушителей наложено административных штрафов на сумму 47,3 тыс. рублей и взыскано 32,2 тыс. рублей.
Помимо охраны территории и борьбы с браконьерством, госинпекторы осуществляют сбор первичной научной информации, принимают участие в учётах животных (зимний маршрутный учёт млекопитающих, учёт тетеревиных птиц и др.), сопровождают научных сотрудников, работают с посетителями — и это далеко неполный перечень обязанностей сотрудников отдела охраны.
На снимках – патрулирование на реке и браконьерские петли (фото Иванов И. А.)